Le prestazioni dello strumento sono influenzate da disturbi causati dalle fluttuazioni del campo magnetico esistente intorno alla stanza in cui è installato l' apparecchio.
JEOL ha sviluppato un innovativo sistema di cancellazione attiva dei campi magnetici di facile installazione e controllo.
Questo può essere combinato con una schermatura magnetica passiva.

Principio di funzionamento:
Il segnale ricevuto dal sensore di campo magnetico viene elaborato dal controllore e una corrente di compensazione viene inviata alla bobina Helmholtz (gabbia).
I campi magnetici generati dalla bobina pertanto compensano il campo magnetico ambientale rilevato dal sensore.
La dimensione della "gabbia" è adattabile alla dimensione del microscopio.
La cancellazione dei campi può essere fatta lungo i tre assi X, Y e Z.